Hải quân (海軍, Kaigun?) là một tổ chức quân sự lâu đời trực thuộc Chính phủ thế giới, có các chi nhánh đóng ở khắp mọi nơi trên thế giới One Piece. Hải quân có nhiệm vụ duy trì nền hoà bình và bảo vệ cuộc sống của người dân trên danh "Chính nghĩa". Hình ảnh đặc trưng của lính Hải quân là đồng phục trắng và chiếc áo choàng trắng với hai chữ Hán là 正義 (chính nghĩa, tiếng Nhật đọc là "Seigi") in ở sau lưng. Hải quân là đối trọng của phe Hải tặc và đồng thời là một trong "Tam đại thế lực", duy trì cân bằng của trật tự cho giới. Tổng bộ hải quân từng được đặt trên New Marineford ở lối vào của Tân thế giới.

Nguyên soái

Nguyên soái (元帥, Gensui?) hay Thủy sư Đô đốc, là vị trí đứng đầu và có quyền lực cao nhất của Hải quân.

Sakazuki

Sakazuki (サカズキ, Sakazuki?) là Nguyên soái đương nhiệm, biệt danh khi ông còn giữ chức Đại tướng là Akainu (赤犬, nghĩa đen "Chó đỏ"?). Ông theo "Chính nghĩa tuyệt đối". Akainu sở hữu trái ác quỷ Magma Magma (マグマグの実, Magu Magu no Mi?) hệ Logia, cho phép ông có khả năng chuyển hoá cơ thể và có khả năng tạo ra dung nham. Tạo hình của Sakazuki được tác giả Oda Eiichiro dựa trên diễn viên điện ảnh Sugawara Bunta

Đại tướng

Đại tướng (大将, Taishō?) hay Đô Đốc là vị trí mà những người trong này được mệnh danh là những người mạnh nhất của Hải quân. Vị trí này luôn có ba người và có sức mạnh khá đồng đều. Mỗi vị Đại tướng đều có một sức mạnh lớn và độ huỷ diệt rất khủng khiếp.

Kizaru

Kizaru (黄猿, nghĩa đen "Khỉ vàng"?) tên thật là Borsalino (ボルサリーノ, Borusarīno?). Kizaru theo "Chính nghĩa trung lập". Ông sở hữu trái ác quỷ hệ Logia, Pika Pika (ピカピカの実, Pika Pika no Mi?) cho phép ông có sức mạnh và tốc độ của ánh sáng. Là một người lỡ đãng, không nghiêm túc khi đánh nhau và đó cũng là lý do dù đánh bại được 5 thành viên của Thế Hệ Tồi Tệ Nhất nhưng lại để chúng trốn mất. Kizaru có thể sử dụng hai loại Haki thông thường. Oda đã tạo nên Borsalino dựa trên diễn viên điện ảnh Tanaka Kunie

Fujitora

Fujitora (藤虎, nghĩa đen "Hổ Tím"?) tên thật là Issho (イッショウ Isshō). Issho không gia nhập Hải quân theo cách thức truyền thống, ông mới gia nhập trong thời gian gần đây theo lệnh triệu tập nghĩa vụ từ Nguyên soái Sakazuki. Ông tự làm mù mắt mình vì không muốn thấy những điều tồi tệ trên đời, và có chút tiếc nuối khi không được nhìn Luffy khi cậu cứu vương quốc Dressrosa. Ông sở hữu trái ác quỷ hệ Paramecia, Zushi Zushi (ズシズシの実, Zushi Zushi no Mi?), giúp ông điều khiển trọng lực và khả năng điều khiển vật không cần chạm (giống như Telekinesis).

Ryokugyu

Ryokugyu (緑牛, nghĩa đen "Bò xanh"?) hiện chưa rõ danh tính của vị Đại tướng này.

Trung tướng

Trung tướng (中将, Chūjō?) hay Phó Đô Đốc là những người dưới quyền Đại tướng.

Smoker

Smoker (スモーカー, Sumōkā?) hiện giữ chức vụ Trung tướng trực thuộc chi nhánh G5 của Hải quân ở Tân thế giới. Anh có biệt danh là "Thợ săn trắng Smoker" (白猟のスモーカー, Hakuryō no Sumōkā?). Smoker sở hữu trái ác quỷ Moku Moku (モクモクの実, Moku Moku no Mi?) hệ Logia, cho phép anh hoá thân thành khói cũng như điều khiển chúng. Vũ khí của Smoker là một cây thập thủ có bọc đá biển ở đầu. Smoker là một trông số ít các nhân vật phụ xuất hiện xuyên suốt trong nhiều phần truyện.

Monkey D. Garp

Monkey D. Garp (モンキー・D・ガープ, Monkī Dī Gāpu?) được mệnh danh là anh hùng của Hải quân cùng với Sengoku, ông là kì phùng địch thủ của Vua Hải tặc Roger. Biệt danh của ông là "Garp Nắm Đấm" (ゲンコツのガープ, Genkotsu no Gāpu?). Mặc dù thừa khả năng đảm nhiệm vị trí Đại tướng hay xa hơn là Nguyên soái của Hải quân, ông luôn từ chối thăng cấp và chỉ giữ vị trí Trung tướng cho mình. Garp là bố của nhà cách mạng Dragon, ông nội của Luffy và cũng là ông nuôi của Portgas D. Ace, ông nhận nuôi Ace theo nguyện vọng của Roger. Đồng thời ông là thầy của Coby và Hellmepo. Garp sở hữu một sức mạnh và thể lực phi thường với haki rất mạnh.

Thiếu tướng

Thiếu tướng (少将, Shōshō?) hay Đề Đốc.

Hina

Hina (ヒナ , Hina?) giữ chức Thiếu tướng của Hải Quân và là bạn đồng ngũ của Smoker. Hina có biệt danh là "Hắc Hạm Hina" (黒檻のヒナ, Kuro Ori no Hina?). Cô sở hữu trái ác quỷ Ori Ori (オリオリの実, Ori Ori no Mi?) hệ Paramecia, cho phép cô có khả năng khoá đối thủ. Hina là cấp trên của hai nhân vật Fullbody và Jango. Cô xuất hiện lần đầu ở đoạn cuối của phần Alabasta.

Sicily

Akehende

Catacombo

Kadar

Chuẩn tướng

Daigin

Yarisugi

Brannew

Pudding Pudding

Đại tá

Tashigi

Tashigi (たしぎ?, Tashigi?) là cấp dưới của Smoker, hiện cô đang làm việc tại chi nhánh G5 của Hải quân ở Tân thế giới. Tashigi rất đam mê kiếm thuật và thích tìm hiểu về các loại kiếm. Tashigi có mục tiêu là thu thập các thanh kiếm quý trên thế giới để chúng không rơi vào tay kẻ xấu. Ngoại hình và tính cách của Tashigi có nhiều điểm tương đồng với Kuina, người bạn thân đã mất của Zoro

Koby

Koby (コビー, Kobī?) là cậu bé năm xưa từng bị bắt làm việc trên tàu của nữ hải tặc Alvida và được Luffy cứu. Koby gia nhập Hải Quân và làm tạp vụ ở Chi nhánh thứ 153 của Hải Quân sau khi Đại tá Morgan bị đánh bại, trước khi cùng với Hellmepo trở thành học trò của Garp và thuyên chuyển về Tổng Bộ Hải Quân. Koby có nhiều thay đổi và phát triển trong cả thể chất lẫn ngoại hình theo diễn biến của truyện. Hiện Koby đã đang giữ chức Đại tá và là thành viên của tổ chức bí mật "SWORD" của Hải Quân.

T Bone

Very Good

Shu

Sharinguru

Gorilla

Nezumi

Trung tá

Donquixote Rosinante

Ripper

Thiếu tá

Helmeppo

Đại úy

Zotto

Trung úy

Stalker

Rokkaku

Thiếu úy

Makko

Isuka

Chuẩn úy

Thượng sĩ

Trung sĩ

Mashikaku

Shine

Asahija

Hạ sĩ

Binh nhất

Lines

Binh nhì

Ukkari

Fullbody

Jango

Tân binh

Tạp vụ

Tổng Thanh tra

Sengoku

Sengoku (センゴク?, Sengoku?) là Nguyên soái tiền nhiệm của Hải quân trước Timeskip, ông có biệt danh là "Phật Sengoku" (仏のセンゴク, Hotoke no Sengoku?). Sengoku cùng Trung tướng Garp là hai tượng đài Hải quân đã gánh vác Hải quân từ thời Roger, và là một trong các huyền thoại của thế giới One Piece còn sống đến này. Ông sở hữu trái ác quỷ Hito Hito, Model: Đại Phật (ヒトヒトの実 モデル：大仏, Hito Hito no Mi Moderu: Daibutsu?) hệ Zoan Thần Thoại, giúp ông có thể hoá thân thành một hình dạng giống với Phật. Sau trận đại chiến tại Marineford, ông thôi chức Nguyên soái và hiện tại đang đảm nhận nhiệm vụ đặc biệt Tổng Thanh tra của Hải quân.

Đội Khổng lồ

Lacroix

Ronse

SWORD

Đội bí mật đặc biệt trực thuộc tổng bộ Hải Quân do X Drake làm Đội trưởng.

Đơn vị Khoa học

Vegapunk

Nhà khoa học thiên tài đang làm việc cho Hải Quân và Chính phủ Thế giới

Sentomaru

Sentomaru là vệ sĩ riêng của Vegapunk và là Đội trưởng Đội Khoa học. Hiện tại thì Senomaru đã có chức vụ bên Hải Quân nhưng không rõ là gì.

Pacifista

Đội quân Pacifista là các cyborg được tiến sỹ Vegapurk chế tạo theo ngoại hình của Kuma và có khả năng bắn ra tia laze như sức mạnh của Kizaru.

SSG

SSG là đội khoa học đặc biệt.

Khác

Bogard

Candre

Bike

Bomba

Bakezo

Jero

Gai

Fishbonen

Kyuji

Koda

Rika